掌机小精灵孵蛋中途换宠物不会影响保底。保底是指在一定次数内必定会获得一个特定的物品或宠物，与之前的选择无关。因此，无论何时换宠物，都不会影响保底的结果。但是，如果中途放弃孵蛋，重新开始孵蛋的话，保底次数就会重新开始计算，此时就会影响保底。
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掌机小精灵可以交换精灵。
但是在特定场所可以和NPC交换；如果是为了进化想要交换，那么改版一般会有解决方法：设置进化后精灵的捕捉点，或修改其他进化方法（无需通信交换）。